Đã có cuộc tranh luận sôi nổi về nguồn gốc của các vệ tinh bất thường khác của Skathi và Sao Thổ, được thúc đẩy bởi quỹ đạo của chúng khác nhau như thế nào so với các vệ tinh khác của Sao Thổ và mặt trời.[15] Các hành tinh và vệ tinh của một hệ hành tinh thường được cho là hình thành bằng cách tích lũy với nhau từ các vật thể trong một đĩa tiền hành tinh.[16] Bởi vì các hạt trong bất kỳ phần nào của đĩa tiền hành tinh thường di chuyển theo các hướng tương tự và với tốc độ tương tự, một mặt trăng được hình thành từ sự hợp nhất của các hạt này nên có một vòng tròn khá, quỹ đạo prograde, xấp xỉ trên mặt phẳng của đĩa tiền hành tinh.[16] Nhưng quỹ đạo bất thường của Skathi, giống như các vệ tinh tự nhiên khác của Sao Thổ có chung quỹ đạo bất thường tương tự, đã thúc đẩy những suy đoán thay thế về nguồn gốc của nó.[2]

Một khả năng là Skathi ban đầu được hình thành ở một nơi khác ngoài vùng lân cận của Sao Thổ, và sau đó bắt đầu đi qua không gian trước khi bị hành tinh này bắt giữ.[15] Tuy nhiên, cũng có thể Skathi là một mảnh vỡ đã bị đánh bật khỏi một trong những mặt trăng khác của Sao Thổ, trong một vụ va chạm với một vật thể khác.[17] Bởi vì quỹ đạo có thể cực kỳ hỗn loạn và nhạy cảm với các điều kiện ban đầu, có thể một số loại va chạm có thể tạo ra một quỹ đạo cực kỳ bất thường như Skathi, mặc dù các quỹ đạo này thường không ổn định trong khoảng thời gian rất dài.[15]